Liquid Array Diagnostics Technology for SARS-CoV-2 variant detection

Abstract

Dette prosjektet tar sikte på å møte etterspørselen etter nøyaktig diagnostikk og terapier for SARS-CoV-2 ved å lage en multipleksanalyse som bruker Liquid Array Diagnostics (LAD) teknologi. Analysen bruker SNP-genotyping for å oppdage ni spesifikke SNP-er/indeler som er assosiert med 18 distinkte allelvarianter. Dette åpner for et grundig skille mellom virale varianter og villtypen. Effektiviteten av teknikken ble bekreftet ved å analysere kliniske prøver, som inkluderte vellykket identifisering av BQ.1-variasjonen gjennom genotyping. Ytterligere forskning er nødvendig for å forbedre slukkemekanismene til fluorescerende prober, og dermed øke effektiviteten og påliteligheten til analyser i ulike typer prøver.

This project aims to meet the demand for accurate diagnostics and therapies for SARS-CoV-2 by creating a multiplex assay utilizing Liquid Array Diagnostics (LAD) technology. The assay utilizes SNP genotyping to detect nine specific SNPs/indels that are associated with 18 distinct allele variants. This allows for a thorough distinction between viral variants and the wild type. The effectiveness of the technique was confirmed by analyzing clinical samples, which included the successful identification of the BQ.1 variation through genotyping. Additional research is necessary to improve the quenching mechanisms of fluorescent probes, hence increasing the effectiveness and dependability of assays in various types of samples.